在济南设立分公司，是单独汇算清缴还是跟总公司一起呢？
根据国家税务总局关于印发《跨地区经营汇总纳税企业所得税征收管理办法》的公告（国家税务总局公告2012年第57号）的规定：
第二条 居民企业在中国境内跨地区(指跨省、自治区、直辖市和计划单列市，下同)设立不具有法人资格分支机构的，该居民企业为跨地区经营汇总纳税企业(以下简称汇总纳税企业)，除另有规定外，其企业所得税征收管理适用本办法。
第五条 以下二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税：
(一)不具有主体生产经营职能，且在当地不缴纳增值税、营业税的产品售后服务、内部研发、仓储等汇总纳税企业内部辅助性的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
(二)上年度认定为小型微利企业的，其二级分支机构不就地分摊缴纳企业所得税。
(三)新设立的二级分支机构，设立当年不就地分摊缴纳企业所得税。
(四)当年撤销的二级分支机构，自办理注销税务登记之日所属企业所得税预缴期间起，不就地分摊缴纳企业所得税。
(五)汇总纳税企业在中国境外设立的不具有法人资格的二级分支机构，不就地分摊缴纳企业所得税。
根据以上规定，如果分公司当年成立，当年是由总机构直接申报。第二年由总机构分配下来，再从分公司申报。
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